La meilleure façon de (re)partitionner un disque c'est de formater et de repartitionner à partir d'un disque vierge (suppression des partitions existantes et création des nouvelles).
Attention aux logiciels type Partition Magic qui proposent de repartitionner à la volée, sans formatage, mais qui, en cas de foirage, risquent de te faire perdre toutes tes données, et tu n'auras plus qu'à tout reformater et partitionner pour de bon.